木糖醇作為糖醇一類其代謝機理及其實際代謝過程產生的熱量一直存在爭議，有部分學者認為絕大多數木糖醇通過肝臟代謝，其餘大部分被腦及心臟利用，只有少量參與皮下脂肪代謝。但木糖醇被肝臟吸收之後，50%以上會被進一步轉化為葡萄糖，45%左右被氧化，其他很少一部分變成乳酸。
腹瀉
有證據表示過量攝入木糖醇因其在腸道內吸收率不到20%，容易在腸壁積累，易造成滲透性腹瀉。
箭牌口香糖有限公司給廣州日報記者發來書面聲明其中：「根據我們從專家和相關機構收集到的知識，每日攝取木糖醇超過平均90克或單次攝取木糖醇超過平均50克，才有可能引發暫時的消化不適反應。」
全國牙病防治指導組副組長張博學在接受廣州日報採訪中表示：「副作用一定跟攝入的量有關係，木糖醇吃的量大了的確有可能導致輕度腹瀉，但這個『超過量』的具體數值，沒有一個準確的概念和明確的界定。」
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